Muốn diệt chuột đạt hiệu quả cao trước hết phải hiểu được tập tính sinh hoạt của chuột, nắm rõ và điều tra cơ bản về địa điểm tiến hành diệt chuột. Tuy nhiên, trong thực tế muốn khống chế chuột một cách toàn diện đòi hỏi người phải có kinh nghiệm như những công ty chuyên nghiệp trong lĩnh vực này.

Căn cứ vào điều kiên thực tế mà có thể sử dụng một trong các phương pháp diệt chuột như:

• Diệt chuột bằng khí cụ
• Diệt chuột bằng keo dính
• Diệt chuột bằng phương pháp thủ công (Đào hang, hun khói...)
• Diệt chuột bằng phương pháp sinh học (Nuôi mèo, dạy chó bắt chuột...)
• Diệt chuột bằng chất hóa học.
• Diệt chuột bằng phương pháp vi sinh. Đây là phương pháp rất an toàn cho con người và môi trường, dùng một loại bả chứa vi khuẩn đặc trưng gây cho chuột một chứng dịch bệnh khi ăn phải. Kể từ ngày thứ ba trở đi, chuột sẽ chết dần. Những con khoẻ tiếp xúc với con bệnh cũng sẽ bị lây nhiễm và chết theo. Đối với động vật khác, loại vi khuẩn này hoàn toàn vô hại.